透明隔在侧脑室之间，两侧之间有狭窄的腔隙，透明隔腔的上方为胼胝体，下方为穹隆。人们将透明隔腔、Verga腔、透明隔囊肿和Verga腔囊肿统称为“透明隔腔”。若两侧侧脑室间的含液结构的两侧壁向两侧弯曲膨隆，且侧壁间的距离大于或等于10mm，即为透明隔囊肿。
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